El tratamiento fitosanitario es usado para garantizar la introducción y dispersión de plagas a través del embalaje que disminuyen el riesgo de introducción y/o dispersión de plagas cuarentenarias asociadas con la movilización en el comercio internacional de embalaje de madera fabricado de madera en bruto.Las medidas fitosanitarias aprobadas que disminuyen considerablemente el riesgo de introducción y dispersión de plagas a través del embalaje, consisten en el uso de madera descortezada y en la aplicación de tratamientos aprobados.

La responsabilidad del tratamiento fitosanitario por parte del operador autorizado por el ICA, cesa en el momento en que el material de embalajes son despachados al exportador.

Es responsabilidad del exportador usuario de embalajes de madera, el manejo de los mismos bajo condiciones adecuadas de almacenamiento, de manera que no se interrumpa la cadena de seguridad fitosanitaria, utilizando zonas de resguardo que garanticen la no ocurrencia de eventual reinfestación por efectos de contaminación cruzada. Los hornos usados para el  tratamiento térmico fitosanitario están certificados por el ICA, según normativa NIMF-15, formando parte del registro oficial de operadores de embalajes de madera de madera y como empresa autorizada por el Ministerio de Agricultura.